A reação em cadeia da polimerase digital em gotas (ddPCR) é um método promissor para analisar pequenas quantidades de DNA e RNA, com alta sensibilidade, baixo custo e facilidade de leitura, uma vez que dispensa bioinformática, projetando-se como importante alternativa ao sequenciamento de nova geração (NGS) na detecção de biomarcadores para orientar o tratamento do câncer. É o que argumentam os oncologistas André Marcio Murad (foto) e José Claudio Casali, em estudo que integrou o programa científico do ASCO 2020.
O ensaio abrange as principais alterações acionáveis em EGFR (mutações), ALK (fusão, mutações), ROS1 (fusão), BRAF (mutações), KRAS (mutações), NRAS (mutações), PIK3CA (mutações), ERBB2 (Variação do número de cópias CNV), ESR1 (mutações), KIT (CNV) e PDGFRA (CNV).
Até agora, 54 pacientes com câncer metastático foram testados, sendo 14(26%) com câncer de pulmão de células não pequenas (CPCNP), 11(20%) com câncer de mama, 11 (20%) com câncer colorretal , 9 (17%) com melanoma, 4 (7%) com câncer de pâncreas, 3 casos (6%) de câncer de ovário e 2 (4%) de glândulas salivares.
“Nosso painel pode ser utilizado tanto na genotipagem aplicada à terapêutica quanto na detecção de respostas moleculares, bem como na resistência secundária em tumores como pulmão, mama, colo do útero, retal, GIST, melanoma e pâncreas”, descrevem os autores.
A ddPCR detectou alterações genômicas significativas em 19 (35%) pacientes: 5 (9%) mutações no gene KRAS G12V (todos no câncer colorretal), 5 (9%) amplificação do ERBB2 (câncer de mama), 2 (3,65%) mutações EGFR L858R (CPCNP), 2 (3,5%) EGFR del19 mutados (CPCNP), 2 (3,5%) mutações EGFR T790M (CPCNP), 2 (3,5%) mutações BRAF-V600E (cólon e melanoma), 1 (1,8%) ALK Fusão -EML4 (CPCNP). O MAF (Fração de Alelo Mutante) variou de 0,9% a 24%.
Em todos os casos, os resultados foram decisivos para a indicação ou alteração de uma terapia-alvo. O tempo médio de resposta foi de 36 horas e o custo médio dos painéis foi de cerca de 500 USD (mediana de 4 genes por painel).
“Nossos resultados sugerem que o dd-PCR é um método altamente sensível e pode ser usado para uma detecção de rotina das variações genômicas mais importantes para determinar a terapia em pacientes com tumores sólidos avançados”, conclui o trabalho brasileiro.
Referência: Abstract #:e15562 - Publication Only: Developmental Therapeutics—Molecularly Targeted Agents and Tumor Biology - J Clin Oncol 38: 2020 (suppl; abstr e15562) - DOI: 10.1200/JCO.2020.38.15_suppl.e15562
First Author: Andre Marcio Murad, MD, PhD
Meeting: 2020 ASCO Virtual Scientific Program
Track: Developmental Therapeutics—Molecularly Targeted Agents and Tumor Biology
Subtrack: Circulating Biomarkers
Abstract #: e15562
